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    Comment faire des arbres phylogénétiques

    Un arbre phylogénétique est une représentation graphique des relations évolutionnaires qui montre comment les organismes pourraient avoir divergé d'un ancêtre commun. Auparavant, cela était fait par la comparaison de l'anatomie et de la physiologie des organismes vivants et des fossiles, mais maintenant l'information génétique tirée des séquences nucléotidiques de l'ADN est couramment utilisée. Des organismes avec peu de similitudes peuvent être trouvés sur les "branches" séparées d'un arbre phylogénétique et ceux avec des points communs spécifiques seraient situés sur des "branches" de la même branche. Un arbre phylogénétique est une méthode pour comprendre les espèces et les changements évolutifs dans les organismes.

    Choisissez un organisme modèle pour la comparaison des relations. Cela peut être fait avec une espèce, une race ou une séquence nucléotidique qui représente un organisme. Un exemple d'organisme pourrait être une vache. Le reste de l'arbre montrerait à quel point une vache est étroitement liée à d'autres organismes en fonction de traits génétiques.

    Choisissez un groupe externe. Un exogroupe est un organisme moins étroitement apparenté ou une séquence nucléotidique très différente. Si l'organisme modèle est une vache, alors un éventuel exogroupe serait un poisson. Plus les deux organismes sont différents, plus l'arbre phylogénétique est éloigné de leur branche divergente. Le temps est représenté avec la date la plus ancienne au bas du graphique et le jour présent étant en haut du graphique. Le placement des branches montre approximativement quand dans le passé un trait évolutionnaire a possiblement changé un organisme ancestral en différentes espèces.

    Déterminer un ensemble de caractéristiques à utiliser pour la comparaison. Les exemples incluent «a quatre jambes», «mâche la boue», «donne naissance vivante» ou «pousse les cheveux». Les séquences nucléotidiques sont simplement des représentations alphabétiques de l'ADN qui déterminent les caractéristiques, donc une autre option serait: "contient la séquence ATGGACACGGA".

    Diviser les organismes en fonction des caractéristiques. Quand un organisme ne contient pas le trait désiré, une branche est faite dans l'arbre phylogénétique. Pour la caractéristique "a quatre pattes", les vaches, les moutons et les cerfs seraient tous sur une branche, alors que le poisson serait sur une branche séparée. Collez l'image ou la séquence d'une vache dans le coin supérieur du tableau d'affichage et le poisson dans le coin opposé et dessinez deux lignes d'eux à la base du papier dans une forme de V en intersection.

    Continuer à séparer le des organismes modèles ou des séquences nucléotidiques jusqu'à ce que chaque exemple ait une seule séparation de la branche en une brindille. La caractéristique "a la laine" séparerait les moutons des chevreuils et des vaches sur une branche singulière. Placez l'image du mouton près de l'image du poisson et dessinez une ligne qui se connecte en forme de V jusqu'à la branche de la vache. L'utilisation de la caractéristique "a la queue moelleuse" délimiterait la vache du cerf. Collez l'image du cerf entre la vache et le mouton et dessinez une autre ligne dans une forme en V qui croise au-dessus des lignes de poissons et de moutons. Lorsque chaque espèce a une seule branche, l'arbre phylogénétique est terminé.

    Astuce

    Choisissez un ensemble fini d'organismes ou de séquences. Choisissez des caractéristiques ou des séquences qui divisent les organismes en groupes distincts. Avoir plusieurs supports caractéristiques pour démontrer les relations avec les organismes.

    Avertissement

    Le placement phylogénétique peut être débattu en fonction de nombreuses caractéristiques, et beaucoup de soutien est requis pour les choix de placement. Des équations mathématiques peuvent être nécessaires pour démontrer la probabilité statistique de changements évolutifs. La probabilité de divergence au niveau génétique laisse la place à d'éventuelles inexactitudes dans les arbres phylogénétiques.

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