L’un des défis du séquençage de l’ADN nanopore est que les pores sont très petits et que les molécules d’ADN peuvent être difficiles à y faire passer. Cela peut entraîner des erreurs dans les données de séquençage.
Une équipe de chercheurs de l’Université de Californie à San Diego a développé une nouvelle méthode de simulation qui peut aider à relever ce défi. Les simulations montrent que les molécules d’ADN peuvent traverser plus facilement les pores si elles sont recouvertes d’une couche de molécules d’eau.
Les chercheurs pensent que cette nouvelle découverte pourrait conduire à des améliorations de la technologie de séquençage de l’ADN des nanopores, la rendant plus précise et plus fiable.
Le séquençage de l’ADN nanopore fonctionne en faisant passer une molécule d’ADN à travers un minuscule pore d’une membrane. Le pore est si petit que seules les molécules d’ADN simple brin peuvent passer à travers. Lorsque la molécule d’ADN traverse le pore, elle perturbe le courant électrique qui traverse la membrane. Cette perturbation est détectée par un capteur et la séquence de la molécule d'ADN peut être déterminée en analysant le schéma des perturbations.
L’un des défis du séquençage de l’ADN nanopore est que les pores sont très petits et que les molécules d’ADN peuvent être difficiles à y faire passer. Cela peut entraîner des erreurs dans les données de séquençage. Un autre défi est que les molécules d’ADN peuvent être endommagées lors de leur passage à travers les pores, ce qui peut également conduire à des erreurs.
La nouvelle méthode de simulation développée par les chercheurs de l'Université de Californie à San Diego montre que les molécules d'ADN peuvent traverser plus facilement les pores si elles sont recouvertes d'une couche de molécules d'eau. En effet, les molécules d’eau aident à lubrifier la molécule d’ADN et à réduire la friction entre la molécule d’ADN et le pore.
Les chercheurs pensent que cette nouvelle découverte pourrait conduire à des améliorations de la technologie de séquençage de l’ADN des nanopores, la rendant plus précise et plus fiable.
Le séquençage de l’ADN nanopore a un certain nombre d’applications potentielles, notamment :
* Séquençage rapide de l'ADN d'agents pathogènes, ce qui pourrait aider à diagnostiquer plus rapidement les maladies.
* Séquençage de l'ADN de cellules individuelles, ce qui pourrait aider à identifier les mutations génétiques associées aux maladies.
* Le séquençage de l'ADN ancien, qui pourrait contribuer à faire la lumière sur l'histoire de l'évolution humaine.
Le séquençage de l’ADN nanopore est encore en cours de développement, mais il a le potentiel de révolutionner le domaine du séquençage de l’ADN.
