1. Le groupe 2'-hydroxyle:
* RNA: L'ARN a un groupe hydroxyle (OH) attaché au carbone 2 'de son sucre ribose. Ce groupe hydroxyle rend l'ARN plus sensible à la hydrolyse , un processus où les liaisons phosphodiester reliant les nucléotides sont décomposées par l'eau. Dans des conditions alcalines, cette réaction d'hydrolyse est accélérée.
* ADN: L'ADN n'a pas ce groupe 2'-hydroxyle, n'ayant qu'un atome d'hydrogène (H) à cette position sur son sucre désoxyribose. Cela rend l'ADN beaucoup plus résistant à l'hydrolyse dans les environnements alcalins.
2. Structure de base et dégradation:
* RNA: La présence d'uracile (U) dans l'ARN le rend sujette à désamination , où le groupe amino (-nh2) sur l'uracile est converti en groupe carbonyle (c =o). Cela convertit l'uracile en cytosine (C), conduisant potentiellement à des mutations. Bien que la désamination puisse arriver à l'ARN et à l'ADN, elle est plus répandue dans l'ARN en raison de la présence d'uracile.
* ADN: L'ADN contient de la thymine (T) au lieu de l'uracile. La thymine est moins sujette à la désamination que l'uracile, contribuant à la plus grande stabilité de l'ADN.
3. Structures secondaires:
* RNA: La nature simple brin d'ARN lui permet de former une variété de structures secondaires complexes, y compris des boucles en épingle à cheveux, des boucles de tige et des pseudoknots. Ces structures peuvent être assez fragiles et peuvent être perturbées par des conditions alcalines, contribuant davantage à la dégradation de l'ARN.
* ADN: La structure double brin de l'ADN, avec ses liaisons hydrogène entre les bases complémentaires, offre une plus grande stabilité et une résistance aux perturbations alcalines.
en résumé:
La présence du groupe 2'-hydroxyle, l'instabilité inhérente de l'uracile, et les structures secondaires plus complexes et fragiles rendent l'ARN beaucoup plus vulnérable à la dégradation dans des conditions alcalines par rapport à l'ADN.