Un travail de recherche mené par le Groupe Spectroscopie du Département de Chimie Physique de l'UPV/EHU, et l'Institut Biofisika assure la couverture du dernier numéro du ACS Science centrale journal, qui est l'une des trois principales revues en chimie. Ce groupe de recherche a réussi à déterminer la structure des sucres qui font partie de l'ADN, 2-désoxyriboside, avec une résolution de niveau atomique. Ce qui a été obtenu ici, c'est « une résolution sans précédent; nous avons réussi à positionner spatialement chacun des atomes de ce sucre, " comme le décrit le leader du groupe Emilio J. Cocinero.

Cocinero considère ce résultat comme l'aboutissement d'un travail qui leur a pris plus de dix ans :« Ce résultat a été rendu possible grâce à l'augmentation de la sensibilité du spectromètre à micro-ondes que nous avons dans notre groupe, que nous avons conçu, construit et adapté nous-mêmes et qui compte actuellement parmi les 3 meilleurs appareils de ce type au monde."

L'un des principaux obstacles qu'ils ont dû surmonter était l'énorme variabilité et la flexibilité entre les diverses formes ou conformations pouvant être adoptées par les molécules de 2-désoxyriboside. Les atomes qui forment ces molécules de sucre peuvent être organisés en formant des cycles à cinq ou six chaînons. "Dans la nature, les formes biologiques présentent des cycles à cinq chaînons, mais dans les expériences où le sucre est complètement isolé et retiré de tout solvant et sans qu'il interagisse avec les éléments restants qui composent l'ADN et déterminent sa configuration, la forme de sucres la plus stable que nous obtenions était des cycles à six membres, " expliqua Cocinero.

Pour résoudre cette situation, ils ont eu la collaboration de chercheurs du Département de chimie de l'Université d'Oxford qui les ont aidés à synthétiser les quatre formes que peuvent adopter les 2-désoxyribosides, à la fois dans leurs formes biologiques et dans celles qui n'apparaissent pas dans la nature, et ils les ont bloqués, "en ajoutant un groupe méthyle aux sucres pour empêcher certaines formes de s'interconvertir en d'autres, et pouvoir étudier chacun d'eux individuellement, " précise le chercheur.

De cette façon, ils ont pu caractériser de manière isolée la structure de chacun d'eux à l'échelle atomique, et ensuite, avec l'aide de chercheurs de l'Université de La Rioja, ils ont pu analyser comment la structure de ces formes change lorsqu'elles entrent en contact avec le solvant, "ce qui s'apparente davantage au milieu naturel dans lequel on les trouve habituellement. Nous avons vu les différences entre certaines formes et d'autres et les avons caractérisées."

Cette analyse leur a également permis d'émettre l'hypothèse « pourquoi la forme que l'on observe dans la nature est celle qu'on observe et pas une autre. Comme nous l'avons vu, la forme du cycle à cinq chaînons est plus souple et la conformation qu'elle adopte dans la chaîne d'ADN favorise la liaison des nucléotides consécutifs, " il a dit.

Maintenant, armés des instruments qu'ils ont mis au point, ils vont s'attaquer à « l'étude de molécules plus grosses et essayer de construire des systèmes de plus en plus proches des formes biologiques réelles pour apporter de meilleures réponses. Nous cherchons la limite des instruments techniques, " a conclu Emilio J. Cocinero.