Les saprophytes sont des organismes qui obtiennent des nutriments à partir de matières organiques mortes ou en décomposition. Cela inclut les plantes et les champignons qui décomposent les tissus végétaux et animaux morts, ainsi que les bactéries et autres micro-organismes qui décomposent la matière organique du sol et de l’eau. Les saprophytes jouent un rôle important dans le cycle des nutriments dans les écosystèmes et certains sont également utilisés dans la production d'antibiotiques et d'autres médicaments.