Vous êtes-vous déjà demandé comment les scientifiques étudient des fragments minuscules comme votre ADN? Une méthode est l'électrophorèse sur gel. Alors que l'électrophorèse produit généralement des bandes claires, faciles à lire, parfaites pour l'interprétation scientifique, les résultats étalés obscurcissent parfois les données.

TL; DR (trop long; pas lu)

Electrophorèse sur gel permet aux scientifiques de visualiser des échantillons digérés et de mesurer la taille des fragments. Le frottis résulte de gels d'agarose mal préparés, de chargement d'un échantillon non dilué dans les puits ou d'échantillons de mauvaise qualité.

Qu'est-ce que l'électrophorèse?

L'électrophorèse sur gel permet aux scientifiques de visualiser des échantillons digérés des molécules telles que l'ADN et estimer les tailles de ces fragments. Pour effectuer l'électrophorèse, les scientifiques préparent un gel en mettant en suspension l'agarose dans de l'eau bouillante. La polymérisation résultante produit des polymères de sucre entrecroisés de sorte que le gel ressemble un peu à une toile d'araignée au niveau chimique. Les scientifiques utilisent un instrument de coupe pour former des puits dans le gel afin qu'ils puissent charger de très petites quantités d'échantillons digérés dans les puits. Allumer la machine fait passer l'électricité à travers le gel, et les fragments dans les échantillons commencent à se déplacer des puits à l'autre côté du gel. Puisque le gel est en forme de weblike, les plus petits fragments traversent rapidement la matrice, tandis que les plus gros fragments mettent plus de temps à grimper à travers la matrice. Une fois terminé, le gel contient des bandes foncées représentant la distance parcourue par les différents fragments. Les scientifiques mesurent ces bandes et utilisent un calcul logarithmique pour déterminer la taille de chaque fragment en fonction de la distance de migration.

Les scientifiques espèrent des bandes claires, mais parfois les bandes frottent. Ce maculage est généralement le résultat de gels mal préparés, en chargeant des échantillons non dilués dans les puits ou des échantillons de mauvaise qualité.

Préparation du gel insatisfaisant

Quand il s'agit de résultats barbouillés, un coupable probable est un mal gel préparé. Un gel satisfaisant polymérise uniformément, produisant une matrice uniforme à travers le gel dans le plateau de coulée. Si une partie du gel - généralement la moitié inférieure - se forme avant que le scientifique ait fini de verser le plateau entier, le gel résultant sera irrégulier et donnera des résultats maculés.

Trop d'échantillon

Avant de charger les échantillons dans les puits, ces échantillons doivent être suffisamment dilués pour traverser le gel sans déborder les puits. Si un échantillon chargé est trop concentré parce que le scientifique a oublié de le diluer ou a utilisé un facteur de dilution incorrect, les fragments seront trop gros pour les puits et produiront des bavures.

Échantillon de qualité médiocre

résulte également de la mauvaise qualité de l'échantillon. Par exemple, un échantillon d'ADN contaminé avec des protéines ou contenant trop de sel peut produire des taches. Les échantillons dégradés ou dénaturés donnent également des résultats médiocres, y compris les bandes barbouillées.

L'électrophorèse sur gel est une façon étonnante pour les scientifiques de visualiser les échantillons digérés et de déterminer la taille des fragments. Une préparation minutieuse du gel et de l'échantillon minimise la possibilité de maculage et donne des bandes claires idéales pour l'interprétation scientifique.