L'ADN - l'acide désoxyribonucléique - est une molécule dans le noyau d'une cellule qui contient des informations génétiques. Extraire l'ADN implique une série d'étapes pour ouvrir délicatement la cellule, briser la membrane nucléaire, séparer l'ADN des protéines, puis provoquer sa précipitation hors d'une solution. Ceci est accompli en utilisant divers produits chimiques, basés sur la structure des membranes, l'ADN et son électronégativité. Le chlorure de sodium, ou d'autres composés contenant du sodium, sont utilisés pour stabiliser l'ADN après qu'il a été dépouillé de ses protéines et aider à la précipitation.
La structure de l'ADN
La structure de base de l'ADN Ce sont deux longs brins de nucléotides reliés par des squelettes de sucre-phosphate qui les entourent. L'ADN est en outre disposé par torsion et enroulement sur lui-même, avec diverses protéines associées pour maintenir les brins organisés et démêlés. Dans son état natif, la partie de l'ADN la plus proche de l'environnement est l'épine dorsale du sucre-phosphate. Dans la cellule, cet environnement est principalement de l'eau; dans lequel l'ADN est soluble. Il est soluble dans l'eau en raison de sa polarité globale.
Polarité de l'ADN
"Polarité" est un terme chimique décrivant les molécules qui contiennent une distribution inégale des charges électriques. Selon Paul Zumbo de Cornell Medical College, tous les acides nucléiques sont polaires. Dans le cas de l'ADN, les groupes phosphate hautement polaires sur le squelette portent des charges négatives. Cette propriété explique la solubilité dans l'eau, car l'eau est également polaire. Les charges positives de l'eau interagissent avec les charges négatives de l'ADN et font une solution. Pour récupérer l'ADN pour d'autres tests ou la visualisation, l'ADN doit être précipité hors d'une solution avec de l'eau. Puisque l'eau a une charge positive relativement faible, ceci est accompli en fournissant un ion chargé positivement plus fort dans la solution. Le sodium est le candidat parfait pour cela.
Précipitation de l'ADN en utilisant du sodium et de l'alcool
Une fois que l'ADN a été retiré du noyau d'une cellule et autorisé à se mélanger à l'eau, crée une attraction temporaire entre le sodium et l'épine dorsale. L'ADN est temporairement neutralisé puis facilement dissocié de l'eau. A ce stade, l'introduction d'un alcool force l'ADN et les ions sodium à se lier encore plus étroitement, car l'alcool est très apolaire. L'éthanol ou l'alcool isopropylique peuvent être utilisés. Une fois que l'ADN est dissocié de l'eau et étroitement lié au sodium, il précipite hors de la solution où il peut être soit concentré pour la purification ou visualisé en l'enroulant doucement autour d'une tige de verre lisse.
Autres étapes Extraction de l'ADN
Briser la membrane plasmique et la membrane nucléaire pour accéder à l'ADN des cellules est généralement accompli en introduisant d'abord un détergent d'une certaine sorte pour briser les molécules lipidiques. Un détergent commun utilisé dans les laboratoires est le SDS ou le dodécylsulfate de sodium; mais pour les extractions simples, même le savon à vaisselle peut être utilisé. Si les cellules sont dérivées de matériel végétal, des enzymes sont habituellement ajoutées pour digérer la paroi cellulaire.