Le complexe central se compose de plusieurs régions interconnectées, dont le protocérébrum, le corps ellipsoïde et le corps en forme d'éventail. Chacune de ces régions reçoit des entrées sensorielles provenant de différentes modalités et contribue à la représentation globale de la position et du mouvement de la mouche.
Le protocérébrum contient des neurones qui traitent les informations visuelles. Ces neurones reçoivent les informations des yeux composés de la mouche et calculent la direction et la vitesse de mouvement de la scène visuelle. Le corps ellipsoïde, quant à lui, intègre les signaux vestibulaires des antennes et des licols de la mouche (petites structures en forme de massue près des ailes). Ces signaux fournissent des informations sur les mouvements de la tête et les rotations du corps de la mouche.
Le corps en forme d'éventail reçoit les informations des neurones proprioceptifs situés dans les pattes et les ailes de la mouche. Ces neurones fournissent des informations sur la position et le mouvement des appendices de la mouche. En intégrant les informations de ces différentes entrées sensorielles, le complexe central génère une représentation complète de la position de la mouche dans l'espace.
Le complexe central envoie des signaux à d'autres régions du cerveau, notamment aux centres de contrôle moteur, qui utilisent ces informations pour coordonner les mouvements de la mouche et maintenir sa stabilité pendant le vol et d'autres comportements.
L'étude du complexe central de la mouche a fourni des informations précieuses sur les mécanismes neuronaux qui sous-tendent la navigation spatiale et le contrôle des mouvements. Ces recherches ont également contribué au développement de systèmes de navigation et de contrôle bio-inspirés pour les véhicules autonomes et d’autres applications robotiques.