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  • La recherche montre comment les molécules d'ADN traversent les nanopores
    Les molécules d'ADN se déplacent à travers les nanopores sous l'effet d'une tension appliquée, un phénomène fondamental pour le séquençage de l'ADN et d'autres applications en nanobiotechnologie. Malgré de nombreuses études expérimentales et informatiques, le mécanisme détaillé de la translocation de l’ADN reste flou. Ici, nous avons utilisé des simulations de dynamique moléculaire atomistique de longue durée en conjonction avec des expériences de translocation pour élucider la dynamique de décompression. Les simulations révèlent que la translocation d'une seule molécule d'ADN est médiée par une dynamique collective de plusieurs paires de bases qui interagissent de manière coopérative avec la surface du nanopore. La dynamique de décompression présente des salves intermittentes, conduisant à la translocation des bases d’ADN avec un pas de 0,34 nm, soit la moitié du pas de l’ADN double brin. Cette découverte résout le débat de longue date sur la question de savoir si la taille du pas de translocation de l'ADN est de 0,34 nm ou de 0,68 nm. Nos résultats révèlent les détails atomistiques du mécanisme de translocation et donnent un aperçu de la conception de dispositifs basés sur des nanopores pour l'analyse et la manipulation de l'ADN.
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