*Une équipe de recherche identifie un nouveau phénomène qui conduit à une meilleure compréhension de la méthode*
Le séquençage de l'ADN est un élément clé de la biologie moderne et est utilisé dans de nombreux contextes tels que le diagnostic médical, la médecine légale et la biologie évolutive. De nombreuses nouvelles techniques sont récemment apparues pour le séquençage de l’ADN, offrant de nombreux avantages par rapport au séquençage Sanger auparavant dominant. Ces nouvelles techniques emploient des méthodes plus rapides et moins coûteuses, permettant souvent le séquençage de fragments d’ADN en quelques heures. Le séquençage des nanopores utilise des nanopores biologiques ou synthétiques pour forcer des molécules uniques d'ADN ou d'ARN à travers un pore protéique. Ce processus peut ensuite être utilisé pour établir la séquence de nucléotides le long d’un brin d’ADN ou d’ARN.
Une nouvelle étude menée par le Dr Sebastian Getfert, le Dr Jörg Bewarder, tous deux post-doctorants au Département de physique, et le professeur Ulrich Rant, chef du département, a identifié un nouveau phénomène qui influence la détection des nanopores et améliorera donc la compréhension et application de cette technologie.
Actuellement, la détection des nanopores dans les pores biologiques repose sur le ralentissement contrôlé de la translocation des molécules d'ADN en appliquant un champ électrique sur le nanopore. Les chercheurs montrent, grâce à des simulations de dynamique moléculaire à plusieurs échelles, qu’en présence de ce champ, des parties de l’ADN peuvent temporairement sortir du pore et s’écouler dans le solvant, ce qui affecte le signal d’ADN mesuré et peut entraîner des difficultés d’interprétation des données.
Getfert et Rant :« La détection des nanopores est une technologie très prometteuse et nos travaux contribuent à la compréhension fondamentale du processus de détection des nanopores, permettant ainsi aux scientifiques de développer et d'optimiser davantage la méthode. »
L'étude du département de physique a été publiée récemment dans la célèbre revue scientifique Nature Communications.
