Les collaborateurs de la Mayo-Illinois Alliance for Technology Based Healthcare ont développé un nouveau test de molécule unique pour détecter l'ADN méthylé. La méthylation - l'ajout d'un groupe méthyle de molécules à un brin d'ADN - est l'un des moyens de réguler l'expression des gènes. Les résultats apparaissent dans le numéro actuel de Rapports scientifiques .
"Alors que les nanopores ont été étudiés pour le séquençage génomique et l'analyse de criblage, ce nouveau test peut potentiellement contourner le besoin de certains des processus actuels d'évaluation des maladies liées à l'épigénétique, " dit Georges Vasmatzis, Doctorat., co-responsable du programme de découverte de biomarqueurs de Mayo au Center for Individualized Medicine et co-auteur principal de l'article. Il dit que le test pourrait éliminer le besoin de conversion au bisulfite de l'ADN, marquage fluorescent, et la réaction en chaîne par polymérase (PCR).
"Les prochaines étapes incluent l'augmentation de la résolution spatiale en incorporant des membranes plus minces et en intégrant les mêmes étapes de préparation, " dit Rachid Bashir, Doctorat., professeur de bio-ingénierie, directeur du Laboratoire de Micro et Nanotechnologies, et co-auteur principal de l'étude à l'Université de l'Illinois à Urbana-Champaign.
Un nanopore, dans ce cas, est un très petit trou dans une membrane artificielle, qui ne permet de localiser et d'identifier qu'une seule molécule. Les chercheurs disent que cela est utile car la méthylation dans les séquences de promoteurs peut indiquer le développement de tumeurs dans la plupart des principaux types de cancer et peut être un meilleur biomarqueur que de nombreux marqueurs génétiques. Les scientifiques sont désormais capables de différencier l'ADN méthylé de l'ADN non méthylé en fixant une protéine sur les nucléotides méthylés en mesurant le courant électrique ionique via un nanopore à l'état solide.