En général, le type de substrat et la force de l’interaction entre le substrat et l’adsorbat détermineront la nature des interactions électroniques. Par exemple, si le substrat est un métal, les électrons de l’adsorbat peuvent facilement être transférés vers le métal, entraînant une forte interaction électronique. Ceci peut conduire à la formation d'un complexe de transfert de charges voire d'une liaison chimique entre l'adsorbat et le substrat.
En revanche, si le substrat est semi-conducteur, l’interaction électronique entre l’adsorbat et le substrat sera plus faible. En effet, la bande interdite d’un semi-conducteur est plus grande que celle d’un métal, il est donc plus difficile pour les électrons de se transférer entre l’adsorbat et le substrat. Cependant, l’interaction électronique entre l’adsorbat et le substrat peut toujours être importante et entraîner des modifications dans la structure électronique de l’adsorbat.
La force de l’interaction électronique entre l’adsorbat et le substrat peut également être influencée par la rugosité de la surface du substrat. Une surface rugueuse fournira davantage de sites avec lesquels l'adsorbat pourra interagir, ce qui entraînera une interaction électronique plus forte. En effet, la rugosité de la surface augmente le nombre d'atomes de surface disponibles pour interagir avec les électrons de l'adsorbat.
En résumé, le substrat peut avoir une influence significative sur les interactions électroniques des molécules adsorbées à sa surface. Le type de substrat, la force de l’interaction entre le substrat et l’adsorbat et la rugosité de la surface du substrat détermineront tous la nature des interactions électroniques.