Les lynx sont des prédateurs, mais cela ne veut pas dire qu'ils n'ont pas d'ennemis. Une des raisons pour lesquelles les lynx roux sont nerveux, c'est parce qu'ils ont un rôle de proie et de chasseur. Longs de 2 à 3 pieds, les lynx roux sont assez petits pour être menacés par d'autres carnivores comme les coyotes. Les chatons Bobcat en particulier sont une proie potentielle pour de nombreux prédateurs. En raison des menaces auxquelles font face les lynx roux, l'âge maximum à l'état sauvage est d'environ 12 ans et la moyenne est d'environ 6. En captivité, sans menaces, un lynx roux peut vivre jusqu'à 30 ans ou plus.
Oiseaux
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Les faucons, les aigles et les hiboux peuvent tous et vont prendre des chatons ou des juvéniles. Les mères restent avec leurs chatons jusqu'à ce que leur progéniture puisse se débrouiller toute seule. Cependant, il y a des moments où un faucon opportuniste pourrait attraper un chaton bobcat. Les oiseaux de proie ne constituent pas un danger important pour le lynx roux mais constituent une menace possible.
Mammifères
Les autres carnivores, notamment les coyotes, les pêcheurs, les couguars, les loups et les lynx, sont dangereux pour les lynx roux. . Ils sont également en compétition avec les lynx roux, et quand la nourriture est rare, les lynx roux peuvent s'en passer. La mortalité juvénile est directement liée à l'approvisionnement alimentaire et, en période de pénurie alimentaire, de nombreux chatons du genre Bobcat meurent. Les porcs-épics sont des animaux proies mais peuvent causer des dommages aux lynx roux avec des épines vénéneuses.
Humains
Les mammifères les plus dangereux pour les lynx roux sont bien sûr les humains. Les trappeurs et les chasseurs ciblent les lynx pour leur fourrure. En fait, à compter de 2011, les peaux de lynx et de lynx représentaient au moins la moitié de toutes les fourrures de chats commercialisées dans le monde. Dans certaines parties des États-Unis, les humains ont complètement éliminé le lynx roux; à la fois délibérément par le piégeage pour la fourrure ou la persécution délibérée et accidentellement par la destruction de l'habitat.
Les microorganismes
Les vrais ennemis naturels du lynx roux ne sont pas d'autres prédateurs mais beaucoup plus petits micro-organismes. Comme la plupart des autres animaux, les lynx roux sont vulnérables à toute une gamme d'infections et de maladies, y compris la rage et la maladie de Carré. Après les humains, les principales menaces pour les lynx adultes semblent être les maladies et les parasites.