* d-galactose (un sucre à six carbones)
* 3,6-anhydro-l-galactose (un sucre à six carbone modifié)
Ces unités agarobiose sont liées ensemble par alternativement α- (1 → 3) et β- (1 → 4) liaisons glycosidiques .
En plus de la structure d'agarobiose principale, l'agarose peut également contenir de petites quantités d'autres sucres comme sulfate , acides uroniques , et acide pyruvique ainsi que protéines et sels .
La présence de ces composants supplémentaires peut varier en fonction de la source des algues à partir desquelles l'agarose est extraite, entraînant de légères variations des propriétés physiques de l'agarose.
