Le nombre d'atomes que chaque élément présent dans une molécule est indiqué par les indices .

Par exemple, dans la molécule H₂o (eau):

* L'indice "2" après le "H" indique qu'il y a deux atomes d'hydrogène.

* L'indice "1" après le "O" (qui n'est généralement pas écrit) indique qu'il y a un Atome d'oxygène.