Lyse cellulaire :le SDS, un détergent anionique, perturbe la bicouche phospholipidique des membranes cellulaires en interagissant avec les queues hydrophobes des phospholipides. Cette interaction conduit à la désintégration de la membrane, provoquant l’ouverture de la cellule et la libération de son contenu.
Solubilisation des composants cellulaires :Après la lyse cellulaire, le SDS aide à solubiliser et à maintenir la solubilité de divers composants cellulaires, notamment les protéines et les lipides, en les dénaturant et en les empêchant de s'agréger. Cela garantit que l’ADN reste accessible et facilite les étapes ultérieures du processus d’isolement.
Dénaturation des protéines :le SDS a la capacité de dénaturer les protéines, ce qui est crucial pour l'isolement de l'ADN. Les protéines se lient étroitement à l’ADN et peuvent gêner son extraction. En dénaturant les protéines, le SDS perturbe ces interactions protéine-ADN, permettant ainsi une séparation efficace de l'ADN des autres composants cellulaires.
Accessibilité de l'ADN :La dénaturation des protéines expose également les molécules d'ADN, les rendant plus accessibles aux enzymes et aux réactifs utilisés dans les étapes ultérieures du protocole d'isolement de l'ADN.
Complexes SDS-Protéines :Le SDS forme des micelles, qui sont des structures sphériques avec un intérieur hydrophobe et un extérieur hydrophile. Les protéines dénaturées se lient aux régions hydrophobes des micelles SDS, formant des complexes qui les maintiennent en solution et empêchent leur interférence avec la purification de l'ADN.
Précipitation des acides nucléiques :Dans certaines méthodes d'isolement de l'ADN, telles que la méthode CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide), le SDS peut être utilisé pour améliorer la précipitation des acides nucléiques. Il forme des complexes avec CTAB, qui à son tour se lie au squelette d'ADN chargé négativement, favorisant la formation de précipités denses d'acide nucléique-détergent qui peuvent être facilement agglomérés par centrifugation.
Il est important de noter que le SDS peut inhiber l'activité de certaines enzymes, telles que les enzymes de restriction. Sa concentration et la durée de son exposition à l'ADN doivent donc être soigneusement contrôlées pendant la procédure d'isolement de l'ADN afin d'éviter sa dégradation.
