Crédit :Université du Nouveau-Mexique
Jérémy Edwards, directeur du laboratoire Computational Genomics and Technology (CGaT) de l'Université du Nouveau-Mexique, et ses collègues de Centrillion Technologies à Palo Alto, Californie et West Virginia University, ont développé une puce qui fournit une méthode plus simple et plus rapide de séquençage du génome pour des virus comme COVID-19.
Leurs recherches, intitulé « Highly Accurate Chip-Based Resequencing of SARS-CoV-2 Clinical Samples » a été publié récemment dans la revue American Chemical Society Langmuir . Dans le cadre de la recherche, les scientifiques ont créé une matrice de génome en mosaïque qu'ils ont développée pour un reséquençage complet du génome viral rapide et peu coûteux et ont appliqué leur matrice de mosaïque de génome spécifique au SRAS-CoV-2 pour reséquencer rapidement et avec précision le génome viral à partir de huit échantillons cliniques acquis auprès de patients du Wyoming qui ont été testés positifs pour SRAS-CoV-2. Finalement, ils ont pu séquencer 95 pour cent du génome de chaque échantillon avec une précision supérieure à 99,9 pour cent.
« Cette nouvelle technologie permet un traçage plus rapide et plus précis du COVID et d'autres virus respiratoires, y compris l'apparition de nouvelles variantes, " dit Edwards, qui est professeur au département de chimie et de biologie chimique de l'UNM. "Avec cette procédure de test simple et rapide, les scientifiques seront en mesure de suivre plus précisément la progression et de mieux prévenir l'apparition de la prochaine pandémie."
Séquence complète du génome du SRAS-CoV-2. Crédit :Université du Nouveau-Mexique
Avec plus de 142 millions de personnes dans le monde ayant contracté le virus, Les tests vigilants et la recherche des contacts sont les moyens les plus efficaces pour ralentir la propagation du COVID-19. Les méthodes traditionnelles de tests cliniques produisent souvent des faux positifs ou négatifs, et les méthodes traditionnelles de séquençage prennent du temps et sont coûteuses. Cette nouvelle technologie éliminera pratiquement tous ces obstacles.
« Depuis la soumission de l'article, la technologie a encore évolué avec une précision et une sensibilité améliorées, " a déclaré Edwards. " La technologie des puces est la meilleure technologie disponible pour la surveillance du génome viral à grande échelle et le suivi des variantes virales. Cette technologie pourrait non seulement aider à contrôler cette pandémie et également à prévenir de futures pandémies. »
