Ce qui empêche nos cellules d'être surexposées aux ions fer circulant librement dans le corps est une protéine appelée lactoferrine, connu pour sa capacité à se lier étroitement à de tels ions. Ces ions libres sont essentiels pour un certain nombre de processus biologiques. S'il est trouvé en quantité excessive, cependant, ils pourraient endommager les protéines et l'ADN du corps, parfois même conduisant à la mort cellulaire. En effet, les ions fer libres entraînent une augmentation de la concentration de substances réactives au pouvoir oxydant se déplaçant librement dans le corps. Cela a conduit les scientifiques à mieux comprendre comment le changement structurel de la lactoferrine aide à lutter contre les ions fer libres.
Dans une nouvelle étude publiée dans EPJ E , Lilia Anghel de l'Institut de chimie de Chisinau, République de Moldavie, et des collaborateurs de recherche étudient les changements dans la structure de la lactoferrine lorsqu'elle se lie aux ions fer, en utilisant des simulations combinées de dynamique expérimentale et moléculaire.
Les scientifiques qui ont déjà étudié la structure cristalline aux rayons X de la lactoferrine humaine ont montré que des changements de conformation au sein de la structure de la protéine se produisent lorsque l'ion fer s'y lie. Dans cette étude, les auteurs s'appuient sur une méthode appelée diffusion de neutrons aux petits angles pour détecter les différences structurelles entre la conformation ouverte et fermée de la lactoferrine humaine en solution.
Les auteurs démontrent qu'un acide aminé, à savoir l'arginine 121, joue un rôle clé dans la stabilité de la conformation de la protéine lactoferrine. En outre, en se concentrant sur la compréhension de la façon dont la lactoferrine humaine passe de sa conformation ouverte à sa conformation fermée, ils constatent également que la conformation ouverte semble offrir un rayon de torsion plus petit que celui de la version fermée.
Dernièrement, ils détectent les différences visibles entre les deux basse résolution, modèles tridimensionnels de structure ouverte et fermée de lactoferrine humaine en solution. Les deux ont une conformation plus compacte que les structures à haute résolution.
