Des chercheurs de la North Carolina State University ont créé un nouveau service en ligne, ChemMaps, qui permet aux utilisateurs de naviguer de manière interactive dans l'espace chimique de plus de 8, 000 médicaments et 47, 000 composés environnementaux en 3D et en temps réel. ChemMaps est conçu pour être une ressource centrale pour les étudiants et les chercheurs qui souhaitent visualiser et étudier facilement des ensembles complexes de structures chimiques.

La première version du site Web gratuit est disponible à l'adresse http://www.chemmaps.com.

"Le postulat de ChemMaps était d'en faire le Google Maps des médicaments, " dit Denis Fourches, professeur assistant de chimie à NC State. « Il permet à toute personne utilisant un ordinateur ou une tablette de parcourir et de naviguer facilement dans l'espace chimique des médicaments commercialisés dans un environnement 3D. Nous voulions vraiment rendre l'interface graphique de ChemMaps pertinente pour un étudiant ou pour un spécialiste en chimie médicinale. "

Avec ChemMaps, les produits chimiques ressemblent à des étoiles, des points lumineux dispersés sur l'écran. Chaque étoile, ou composé, se positionne par rapport aux autres au sein de l'espace chimique complexe en fonction de leurs propriétés structurelles. Lorsqu'un utilisateur clique sur une étoile composée particulière, plusieurs caractéristiques clés de ce produit chimique sont affichées :son nom systématique, marque, structure chimique, indication médicale, identifiants externes, et d'autres propriétés physico-chimiques.

Actuellement, il y a deux cartes principales disponibles. La DrugMap comprend environ 8, 000 médicaments (commercialisés, en développement et retiré) et a été préparé à partir de la base de données DrugBank. La carte environnementale, ou EnvMap, comprend plus de 47, 000 composés (tels que les pesticides ou les retardateurs de flamme) pertinents pour le National Institute of Environmental Health Studies (NIEHS) et l'Environmental Protection Agency (EPA) des États-Unis et ont été préparés à partir du Tox21, Toxcast, et d'autres bases de données NIEHS.

Les chercheurs prévoient d'ajouter des fonctionnalités au fil du temps, y compris la possibilité pour les collaborateurs et les entreprises de visualiser et de projeter des ensembles exclusifs de produits chimiques sur les ChemMaps. Ils prévoient également de rendre les cartes encore plus interactives, facile à manipuler, et compatible avec les appareils de réalité augmentée et virtuelle.

"C'est le premier outil du domaine public qui permet à n'importe qui, notamment les non-spécialistes de la chimioinformatique, facilement, accéder visuellement et rapidement à toutes ces informations chimiques complexes en un seul endroit, " Fourches dit. "Cet outil pourrait aider les chercheurs à mieux comprendre le voisinage chimique d'un composé particulier. En réalité, ceci est essentiel pour la réutilisation des médicaments ou l'évaluation des risques chimiques. »

La recherche apparaît dans Bioinformatique . Dr Alex Borrel, ancien boursier postdoctoral de l'État de Caroline du Nord actuellement au NIEHS et premier auteur de l'article, créé le programme. Fourches a conçu ChemMaps et est l'auteur correspondant. Dr Nicole Kleinstreuer, biologiste informatique au NIEHS, également contribué aux travaux.