La différence la plus évidente entre les cellules procaryotes et eucaryotes est la présence d'un noyau .

* cellules eucaryotes avoir un vrai noyau enfermé par une membrane, qui abrite leur ADN.

* cellules procaryotes manque de noyau et leur ADN est situé dans une région appelée nucléoïde , qui n'est pas enfermé par une membrane.

Cette différence dans l'organisation de l'ADN est fondamentale et conduit à de nombreuses autres différences dans la structure et la fonction de ces deux types de cellules.