* par volume: virus sont généralement considérés comme les plus petits micro-organismes, certains étant aussi petits que 20 nanomètres de diamètre. Cependant, les virus ne sont pas techniquement des organismes vivants.
* par diamètre: mycoplasma sont un genre de bactéries qui sont parmi les plus petits organismes de vie libre, certaines espèces ne mesurant que 0,1 micromètre de diamètre.
* par taille du génome: nanoarchaeum equitans est un type d'archéon avec le plus petit génome connu, ne contenant que 490 885 paires de bases.
En fin de compte, le «plus petit» micro-organisme dépend de vos critères.
