- Anaérobies obligatoires :ces organismes ne peuvent pas survivre en présence d'oxygène et n'utilisent donc pas l'oxygène comme accepteur final d'électrons dans la respiration cellulaire. Au lieu de cela, ils utilisent des accepteurs d’électrons alternatifs tels que le sulfate, le nitrate ou le fumarate. Des exemples d'anaérobies obligatoires comprennent certaines bactéries et archées.
- Anaérobies facultatifs :ces organismes peuvent alterner entre la respiration aérobie (en présence d'oxygène) et la respiration anaérobie (en absence d'oxygène) en fonction de la disponibilité en oxygène. Lorsque l’oxygène est présent, ils utilisent la respiration aérobie, mais lorsque les niveaux d’oxygène diminuent, ils passent à la respiration anaérobie. Des exemples d'anaérobies facultatifs comprennent la levure, certaines bactéries et certains vers parasites.
- Anaérobies aérotolérants :ces organismes ne se développent normalement pas en présence d'oxygène mais sont capables de survivre ou de se développer en sa présence. Cependant, ils n’utilisent pas l’oxygène comme accepteur terminal d’électrons dans la respiration; ils utilisent des voies alternatives. Certains organismes anaérobies aérotolérants peuvent avoir des enzymes résiduelles pour la respiration, mais ces enzymes ne sont pas actives dans des conditions aérobies. Les exemples incluent certaines bactéries et champignons.
- Microaérophiles :ces organismes ont besoin d'une faible concentration d'oxygène pour se développer et ne peuvent tolérer les niveaux élevés d'oxygène présents dans l'atmosphère. Ils possèdent des enzymes spécialisées et des voies métaboliques qui fonctionnent mieux à de faibles niveaux d’oxygène. Les exemples incluent certaines bactéries et certaines espèces d’archées.
- Archées :si certaines archées effectuent la respiration en utilisant des chaînes de transport d'électrons similaires à celles d'autres organismes, d'autres utilisent des mécanismes différents pour générer de l'ATP. Par exemple, certaines archées emploient des porteurs d’électrons alternatifs, tandis que d’autres utilisent des voies métaboliques uniques comme la méthanogenèse ou l’acétogenèse.