Commencez le processus d'identification des bactéries inconnues en observant leurs caractéristiques physiques, telles que la paroi cellulaire, la forme et les liens. Utilisez des procédures de laboratoire standard, comme la coloration des cellules, la culture et le séquençage d'ADN pour affiner davantage votre identification. Les bactéries sont généralement regroupées en espèces en fonction de leurs caractéristiques physiques et métaboliques, plutôt que de leurs relations génétiques entre elles.
Positives ou négatives

Les eubactéries sont les soi-disant vraies bactéries. Ils sont distincts des archées ou des archéobactéries, qui forment un royaume séparé. Les eubactéries sont des procaryotes, ce qui signifie qu'elles n'ont pas de membrane nucléaire. La plupart ont des membranes cellulaires et des parois cellulaires. Les bactéries dont les parois des cellules sont épaisses sont appelées gram-positives car elles sont susceptibles de mourir lors d'un test appelé coloration de Gram. La coloration de Gram est le premier test utilisé dans la classification bactérienne. Les bactéries dont les parois cellulaires sont minces ou absentes sont gram-négatives car elles ne piègent pas le colorant Gram.
Façonner les bactéries

Les bactéries sphériques sont appelées cocci, les bactéries qui forment des bâtonnets droits sont appelées bacilles et les bactéries avec une forme intermédiaire est appelée coccobacilles. Ceux-ci peuvent tous être à Gram négatif ou à Gram positif. Les bactéries rigides en forme de spirale sont connues sous le nom de spirille et ne sont que gram-négatives. Les bactéries flexibles, mobiles indépendamment, en forme de spirale sont appelées spirochètes et sont gram-neutres. Enfin, les tiges rigides en forme de virgule sont appelées vibrions et sont à Gram négatif. Quelques bactéries peu connues et mal comprises ont des formes différentes, comme la stella en forme d'étoile et les labrys en forme de hache. Il existe également deux groupes bactériens intermédiaires. Les rickettsies sont similaires aux virus, ont une variété de formes, sont gram-négatives et ne peuvent survivre qu'à l'intérieur d'autres cellules. Les mycoplasmes, qui sont similaires aux champignons, sont dépourvus de parois cellulaires et comprennent de nombreux agents pathogènes pulmonaires spécifiques aux espèces.
Cubes, grappes et autres liens

Les cocci et les bacilles sont en outre classés par les liens qu'ils se forment après la division cellulaire. Les diplocoques et les diplobacilles se collent par paires. Les streptocoques et les streptobacilles forment des chaînes. Les cocci tétrades restent dans des carrés de quatre bactéries. Les cocci de Sarcinae forment des cubes de huit bactéries et les staphylocoques forment des grappes.
Identification de la bactérie

Si vous avez une bactérie inconnue et que vous voulez l'identifier, vous effectuerez généralement une coloration de gramme puis observerez la colonie l'apparence et les caractéristiques individuelles. À ce stade, vous pouvez dire que vous avez, par exemple, un streptobacille aérobie à Gram négatif. Vous pouvez ensuite comparer votre échantillon à diverses bactéries connues en le plaçant sur différents milieux de culture qui encouragent la croissance de certaines espèces et en inhibent d'autres, ou en testant l'échantillon pour différents sous-produits bactériens connus. En dernier recours, le séquençage de l'ADN peut déterminer si vous avez une espèce ou une souche bactérienne connue ou inconnue, à condition de la comparer à une espèce ou à une souche dont le génome a déjà été séquencé.