Cependant, les supraconducteurs ne sont pas parfaits et il existe certaines conditions dans lesquelles ils peuvent perdre leur supraconductivité et retrouver un comportement conducteur normal. L'une de ces conditions est l'application d'un champ magnétique. Si un champ magnétique est appliqué à un supraconducteur, il peut amener le matériau à entrer dans un état appelé « état mixte », dans lequel la supraconductivité et la conductivité normale coexistent. À l’état mixte, le supraconducteur peut toujours conduire l’électricité, mais il le fait avec une certaine résistance, ce qui signifie que de l’énergie est perdue sous forme de chaleur.
Une autre condition pouvant faire perdre leur supraconductivité aux supraconducteurs est la présence d’impuretés ou de défauts dans le matériau. Les impuretés et les défauts peuvent créer des perturbations dans le réseau cristallin du matériau, ce qui peut entraver la circulation des supercourants. En conséquence, les supraconducteurs comportant des impuretés ou des défauts ont tendance à avoir des champs magnétiques critiques et des températures de transition inférieurs à ceux des supraconducteurs purs.
Malgré ces limites, les supraconducteurs restent des matériaux extrêmement utiles dans diverses applications, telles que les trains à grande vitesse, les appareils IRM et les accélérateurs de particules.