Alors que les protéines à la surface des cellules sont les cibles de la plupart des médicaments, des méthodes affinées sont nécessaires pour analyser comment ces protéines membranaires sont organisées. Des chercheurs du Karolinska Institutet ont mis au point une nouvelle méthode d'analyse basée sur l'ADN qui pourrait contribuer au développement de futurs médicaments pour le cancer du sein et d'autres cancers. L'étude est publiée dans Nature Nanotechnologie .

L'efficacité de la plupart des médicaments utilisés en clinique est attribuable à leur interaction avec des protéines sur les membranes cellulaires. Il est donc essentiel de comprendre comment ces protéines fonctionnent dans la santé et la maladie.

De nombreuses protéines de la membrane cellulaire sont réparties en unités fonctionnelles, domaines de dimensions nanométriques (c. dix ^-6 mm).

Les protéines membranaires sont analysées par microscopie à super-résolution, une technique limitée par le fait que seul un petit nombre de protéines membranaires - normalement trois - peuvent être analysées en même temps.

Des chercheurs du Karolinska Institutet ont maintenant développé une méthode qui augmente ce nombre. Cette méthode non microscopique pour analyser des populations entières de cellules est appelée NanoDeep (NANOscale DEciphEring of membrane Protein nanodomains).

La méthode est basée sur l'utilisation de l'analyse de l'ADN pour traduire des informations sur l'organisation des protéines membranaires. Il n'y a pas de limites au nombre de telles protéines que NanoDeep peut analyser simultanément. Leurs travaux ont non seulement permis aux chercheurs de corroborer des découvertes antérieures, mais ont également conduit à de nouvelles découvertes.

"NanoDeep a actuellement une résolution dans l'intervalle de 10 nanomètres, c'est 10 milliardièmes de mètre, qui surpasse de nombreuses autres méthodes de microscopie à super-résolution, " dit la dernière auteure de l'étude Ana Teixeira, chercheur au Département de Biochimie Médicale et Biophysique, Institut Karolinska. "NanoDeep a le potentiel d'apporter de nouvelles connaissances sur la régulation de la fonction des protéines membranaires."

En utilisant NanoDeep, les chercheurs ont pu décrire des environnements protéiques entourant le récepteur membranaire Her2, une protéine membranaire qui transmet des informations aux protéines à l'intérieur de la cellule.

Her2 est surreprésenté dans le cancer du sein et d'autres types de cancer. Une meilleure compréhension de Her2 améliorera les chances de développer de nouveaux médicaments qui préviennent la plupart des récidives de ces cancers.

La nouvelle méthode a été développée pour être aussi simple que possible.

"Notre méthode rend l'utilisation des informations sur les organisations spatiales des protéines à l'échelle nanométrique plus accessible comme outil de diagnostic dans les tests cliniques, " dit le premier auteur de l'étude, chercheuse postdoctorale Elena Ambrosetti. "Il peut également être utilisé comme un outil pour développer de nouveaux types de médicaments conçus pour affecter la fonction des protéines membranaires."