La reproductibilité des résultats expérimentaux publiés a récemment attiré l'attention dans de nombreux domaines scientifiques différents. Le manque de disponibilité de données scientifiques primaires originales représente un facteur majeur contribuant aux problèmes de reproductibilité, cependant, la communauté de la biologie structurale a pris des mesures importantes pour rendre les données expérimentales disponibles.

La cristallographie macromoléculaire aux rayons X a ouvert la voie en exigeant la diffusion publique de coordonnées atomiques et d'une multitude de données expérimentales via la Protein Data Bank (PDB) et des projets similaires, faisant du domaine l'un des plus reproductibles des sciences biologiques.

L'IUCr a chargé le Diffraction Data Deposition Working Group (DDDWG) en 2011 d'examiner les avantages et la faisabilité de l'archivage des images de diffraction brutes en cristallographie. Le rapport triennal 2011-2014 du DDDWG a fait plusieurs recommandations clés concernant la préservation des données de diffraction brutes. Cependant, il n'y a plus de mandat pour la divulgation publique des données de diffraction originales.

La ressource intégrée pour la reproductibilité en cristallographie macromoléculaire (IRRMC) fait partie du programme Big Data to Knowledge des National Institutes of Health et a été développée pour archiver les données brutes des expériences de diffraction et, tout aussi important, pour fournir les métadonnées associées. La base de données [Grabowski et al. (2016). Acta Cristal. D72, 1181-1193, DOI :10.1107/S2059798316014716], contient au moment de la rédaction 3070 expériences de diffraction macromoléculaire (5983 ensembles de données) et leurs métadonnées correspondantes partiellement organisées, représentant environ 3% de tous les dépôts dans la banque de données sur les protéines. La ressource est accessible à l'adresse http://www.proteindiffraction.org et peut être recherchée à l'aide de divers critères via un simple, interface simplifiée. Toutes les données sont disponibles pour un accès et un téléchargement illimités. La ressource sert de preuve de concept et démontre la faisabilité de l'archivage des données de diffraction brutes et des métadonnées associées à partir d'études cristallographiques aux rayons X de macromolécules biologiques.

Parler à un journaliste du projet, le chef d'équipe Wladek Minor a déclaré :"Il y a tellement de recherches en cours qu'elles ne peuvent pas toutes être publiées, et souvent les résultats d'études infructueuses n'apparaissent pas dans la littérature. Je pense que la clé du succès est de connaître les expériences infructueuses, nous voulons savoir pourquoi ils échouent".

L'objectif du projet est d'étendre l'IRRMC et d'inclure des ensembles de données qui n'ont pas réussi à produire des structures à rayons X. Cela pourrait faciliter les efforts de collaboration pour améliorer les méthodes de détermination de la structure des protéines et également garantir la disponibilité des données « orphelines » laissées par des chercheurs individuels et/ou des projets de génomique structurelle disparus.