Voici comment cela fonctionne:
* Les acides aminés ont à la fois des groupes fonctionnels acides (groupe carboxyle, -COOH) et de base (groupe amino, -nh2).
* à un pH faible (conditions acides), le groupe carboxyle est protoné (-COOH) et le groupe amino est également protoné (-NH3 +), résultant en une charge positive nette.
* À un pH élevé (conditions de base), le groupe carboxyle est déprotoné (-coo-) et le groupe amino est déprotoné (-NH2), résultant en une charge négative nette.
* À un pH spécifique, appelé point isoélectrique (PI), l'acide aminé existe dans un état neutre, avec un équilibre entre les charges positives et négatives. Ceci est la forme Zwitterionic.
Pour calculer le Pi d'un acide aminé:
* pour les acides aminés avec un seul groupe acide et un groupe de base: Le Pi est simplement la moyenne des valeurs PKA des deux groupes.
* pour les acides aminés avec plus d'un groupe acide ou de base: Le Pi est calculé en faisant la moyenne des valeurs PKA des deux groupes qui sont les plus proches en valeur PKA de l'état neutre.
par exemple:
* glycine: Le PKA du groupe carboxyle est de 2,34 et le PKA du groupe amino est de 9,60. Le pi de glycine est (2,34 + 9,60) / 2 = 5,97 .
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